Hlavnou náplňou odboru je stimulovať účasť subjektov výskumu a vývoja v SR v medzinárodných a európskych programoch a iniciatívach, ako aj podporovať bilaterálnu spoluprácu. Hlavnými nástrojmi stimulácie sú jednoduché podporné finančné schémy, poskytovanie administratívnej a informačnej podpory a tréning projektových manažérov z inštitúcií výskumu a vývoja. Odbor pracuje v úzkej súčinnosti s odborom projektov a náplň činnosti niektorých pracovníkov sa prelína.